همایون پسر استاد محمدرضا شجریان و فرخنده گل افشان می باشد که سه خواهر بزرگتر از خود بنام فرزانه ، افسانه و مژگان و یک برادر کوچکتر ناتنی بنام رایان دارد و قدش 175 سانتیمتر است.
شروع از کودکی
علاقه اش به موسیقی از 4 سالگی با زدن ریتم روی اشیای مختلف شروع شد تا آن که با تشخیص پدر نزد ناصر فرهنگ فر به فراگیری تکنیک و شناخت ریتم که اساس موسیقی است پرداخت و چند سالی هم آموختن را نزد جمشید محبی ادامه داد.
مدتی هم نزد استاد غلامرضا دادبه مشهور به جانسوز کلاس تنبک رفت.
کودکی همایون شجریان
از ساز ملودیک تا آواز
بعد از یادگیری تنبک تصمیم گرفت یک ساز ملودیک را هم یاد بگیرذ که به پیشنهاد و توصیه پدر کمانچه را انتخاب کرد تا اینکه با ورود به آواز کمانچه را رها کرد.
همایون شجریان و خواهرش مژگان شجریان
همخوانی با پدر
او از سال 1370 در 16 سالگی پدرش محمدرضا شجریان را در کنسرت های آمریکا ، اروپا و ایران با تنبک همراهی کرد و از 1378 به بعد در صحنه کنسرت ها به هم خوانی با پدرش پرداخت.